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Phoenix WinNonlin-compatible PK/PD/NCA/Compartmental analysis copilot for Claude Code — version-aware (WinNonlin 5.3/6.4/8.3), CDISC SDTM/ADaM, 21 CFR Part 11 technical controls

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pk-copilot

Phoenix WinNonlin과 수치 호환되는 Pharmacokinetics(PK) / Pharmacodynamics(PD) / NCA / Compartmental Analysis 를 Claude Code에서 자연어로 수행하는 AI 코파일럿 플러그인.

License Version WinNonlin Compat

한 줄 정의

pk-copilot 은 Claude Code 환경에서 자연어로 약동학·약력학 분석을 수행하면서 Phoenix WinNonlin과 수치적으로 일치하는 결정론적 결과를 산출합니다.

핵심 가치

  • ✅ WinNonlin 5.3 / 6.4 / 8.3 호환 — winnonlin_version 옵션으로 알고리즘 기본값 분기
  • ✅ AI 가속화 — 자연어로 데이터 클리닝·매핑·단위 변환·보고서 초안
  • ✅ 결정론적 계산 — LLM은 오케스트레이터, MCP 도구가 계산 (환각 없음)
  • ✅ 재현 가능 — JSON-of-record + 실행 스크립트(.py/.R) 자동 생성
  • ✅ 검증 가능 — PKNCA/NonCompart 와 6+ significant figures 일치

로드맵

버전 범위 상태
v0.1 NCA 단일대상자 (IV/PO) ✅ 완료
v0.2 다대상자 NCA + BE 통계 ✅ 완료
v0.3 1/2/3-구획 모델링 ✅ 완료
v0.4 PK/PD 연결 모델 (Emax, IDR) ✅ 완료
v0.5 리포트 + R 교차검증 ✅ 완료
v1.0 Production release (검증 가능, 규제 미주장) ✅ Released
v2.0 CDISC SDTM/ADaM + Part 11-enabling controls (deterministic path) ✅ Released (현재 — v2.0.1 patch)

빠른 시작

현재 버전: v2.0.2 (Regulated-Capable Edition — CDISC + Part 11-enabling 기술 통제 포함)

# Claude Code plugin (예정)
claude plugin install pk-copilot

# 또는 Python 패키지로 직접 설치
git clone https://github.com/kimmingul/pk-copilot.git
cd pk-copilot
uv venv && uv pip install -e ".[dev,mcp,plot,report,cdisc,compliance]"
uv run pkplugin --version  # 2.0.2
uv run pkplugin doctor

슬래시 명령어

  • /nca — 비구획 분석 (Non-Compartmental Analysis)
  • /pk-fit — 구획 모델 적합
  • /pd-fit — 약력학 모델 적합
  • /be — 생물학적동등성 분석
  • /prep-data — 데이터 클리닝 / 단위 변환
  • /diagnose — 진단 (lambda_z 적합성, hysteresis 등)
  • /report — WinNonlin-스타일 리포트 생성

문서

전체 개발/알고리즘 사양은 docs/ 디렉터리 참조.

규제 / 검증 면책

  • v0.x ~ v1.x : pk-copilot은 탐색적 분석 + 데이터 전처리 + 보고서 초안 도구입니다. 21 CFR Part 11 또는 GxP 검증 시스템으로 사용하기 위해서는 사용자 조직의 자체 검증/SOP/교육이 필요합니다.
  • v2.0 : Part 11-enabling 기술 통제 (audit chain, e-signature, RBAC, WORM lock)를 결정론적 CLI/MCP 실행 경로에 제공합니다. LLM/chat orchestration은 기본 exploratory이며, 통제 모드 사용 절차는 docs/10-21cfr-part11.md §17 참조. pk-copilot은 21 CFR Part 11 compliant 시스템이 아닙니다. 실제 준수는 sponsor의 predicate-rule 판단, validated deployment, SOP, 교육, 계정 거버넌스에 달려 있으며, 이는 사용자 조직의 QMS 책임입니다.

상세 면책은 docs/10-21cfr-part11.md §16–17 참조. 완전한 분리 설계는 docs/14-llm-boundary-disclosure.md 참조.

Execution Modes

pk-copilot은 두 가지 실행 모드를 지원합니다.

Mode When Audit chain emission Suitable for Disclaimer
Exploratory Claude chat (기본값), env 미설정 Off (transcript log only) 탐색적 분석, 가설 검증, 보고서 초안 LLM 출력을 regulatory record로 직접 사용 불가
Controlled CLI 또는 MCP tool, PKPLUGIN_PART11_ENABLED=1 + user dict 전달 On (HMAC hash-chain) Part 11-controlled workflow (customer QMS 하에서) 조직의 SOP/validation 필수; §17 참조

참고: Controlled mode는 "Part 11 compliant"가 아닌 "Part 11-enabling"입니다. 실제 Part 11 준수는 sponsor 조직의 QMS 전체 운영에 달려 있습니다.

기여

docs/11-development-workflow.md 참조. Apache-2.0, DCO sign-off 필수.

라이선스

Apache License 2.0 © 2026 pk-copilot contributors.

Phoenix, WinNonlin은 Certara USA Inc.의 등록상표입니다. pk-copilot은 Certara와 무관하며, WinNonlin의 알고리즘(공개 약동학 방법론)을 참조하나 어떤 WinNonlin proprietary 파일 포맷이나 UI도 복제하지 않습니다.

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Phoenix WinNonlin-compatible PK/PD/NCA/Compartmental analysis copilot for Claude Code — version-aware (WinNonlin 5.3/6.4/8.3), CDISC SDTM/ADaM, 21 CFR Part 11 technical controls

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