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대장암 (Colorectal Cancer) — QSP Model

분류: 종양·소화기 | 약어: CRC | 버전: 1.0 | 날짜: 2026-06-23


질환 개요

대장암(Colorectal Cancer, CRC)은 결장 또는 직장에서 발생하는 악성 종양으로, 전 세계에서 세 번째로 흔하고 두 번째로 사망률이 높은 암입니다 (GLOBOCAN 2020: 연간 약 193만 신규 환자, 93만 명 사망). 대부분의 CRC는 정상 상피 → 선종(adenoma) → 침윤성 암으로 진행되는 Vogelstein 염기서열(APC→KRAS→SMAD4→TP53)을 따르며, 약 15%는 MSI-H 경로를 통해 빠르게 진행됩니다.


병태생리 주요 경로

경로 핵심 분자 임상 의미
Wnt/β-catenin APC(mut), β-catenin, TCF/LEF APC 돌연변이 ~80%, c-Myc/Cyclin D1 과발현
RAS/MAPK KRAS(40%), NRAS(5%), BRAF V600E(10%) 항-EGFR 치료 반응 예측
PI3K/AKT PIK3CA(20%), PTEN 소실 mTOR 활성화, 내성 기전
TP53 R175H/R248W/R273H hotspot 세포주기 정지, 아포토시스 장애
TGF-β/EMT SMAD4(35%), ZEB1/TWIST 전이, 불량 예후
MSI/MMR MLH1/MSH2/MSH6/PMS2 결손 높은 종양변이부담→면역항암제 감수성

분자 아형 (Consensus Molecular Subtypes, CMS)

CMS 주요 특성 치료 전략
CMS1 (MSI Immune) MSI-H, BRAF V600E, 높은 면역활성 항-PD-1/PD-L1 (pembrolizumab)
CMS2 (Canonical) CIN 높음, WNT/MYC 활성화 FOLFOX + anti-EGFR (RAS-WT)
CMS3 (Metabolic) KRAS 돌연변이, 지질대사 이상 FOLFIRI/FOLFOX ± BEV
CMS4 (Mesenchymal) TGF-β 활성, EMT, 간질 침윤 항혈관신생 ± 항-EGFR

모델 구성 (Model Architecture)

기계론적 지도 (Mechanistic Map)

CRC QSP Map

  • 노드 수: 130+ (12개 서브그래프 클러스터)
  • 클러스터: Wnt · RAS/MAPK · PI3K/AKT · TP53/Apoptosis · Cell Cycle · TGF-β/EMT · TME · Immune Checkpoints · Angiogenesis · MSI/MMR · Drug PK/PD · Clinical Endpoints

mrgsolve ODE 모델

20 ODE 구획:

구획 그룹 변수 모델링 내용
5-FU PK FU1, FU2, FU_ic 2-구획 + 세포내 활성화, DPD 대사
Oxaliplatin OX1, OX_DNA 백금-DNA 부가물 형성/복구
Irinotecan IRI1, SN38, SN38G UGT1A1*28 다형성 반영
Bevacizumab BEV1, BEV_VEGF TMDD 모델, VEGF 중화
Cetuximab CTX1 EGFR 점유율
Pembrolizumab PEM1 PD-1 점유율
Tumor Ts, Tr 민감세포/내성세포 로지스틱 성장
Biomarkers CEA, ctDNA 종양 부담 연동
Immune CD8eff T세포 활성도 (PD-1 차단)
VEGF, EGFR_occ, PD1_occ 3 표적 분자 동역학

치료 시나리오 (7개):

# 시나리오 근거 임상시험
1 무치료 (자연경과) —
2 FOLFOX6 MOSAIC (André 2004)
3 FOLFIRI GERCOR (Tournigand 2004)
4 FOLFOX + Bevacizumab NO16966 (Saltz 2008)
5 FOLFIRI + Cetuximab (RAS-WT) CRYSTAL (Van Cutsem 2009)
6 FOLFIRI + Bevacizumab TRIBE (Falcone 2013)
7 Pembrolizumab (MSI-H) KEYNOTE-177 (André 2020)

Shiny 앱 구조 (6 탭)

탭 내용
환자 프로파일 나이·BSA·RAS/BRAF/MSI 상태·CMS 아형·치료 선택
PK 프로파일 5-FU/옥살리플라틴/이리노테칸/베바시주맙/세툭시맙/펨브롤리주맙 농도-시간
PD 주요지표 종양 직경 RECIST 변화, 민감/내성 세포, CD8 T세포 활성도
임상 엔드포인트 최우수 반응, PFS 추정, RECIST 분류
시나리오 비교 다중 요법 동시 비교 그래프 및 요약 표
바이오마커 CEA, ctDNA, 유리 VEGF, EGFR/PD-1 점유율

약물 요약

약물 기전 적응증
5-FU/LV TS 억제 → dTTP 고갈 모든 CRC 1차
옥살리플라틴 백금-DNA 부가물 FOLFOX 백본
이리노테칸 Top1 독 (SN-38) FOLFIRI 백본
베바시주맙 항-VEGF-A (TMDD) 전이성 CRC 1차
세툭시맙 항-EGFR (RAS-WT) CRYSTAL/OPUS
펨브롤리주맙 항-PD-1 MSI-H/dMMR CRC 1차
레고라페닙 다중-키나제 TKI 3차 이상

참고 파일

파일 설명
crc_qsp_model.dot Graphviz 기계론적 지도 원본
crc_qsp_model.svg 벡터 그래픽 (확대 가능)
crc_qsp_model.png 150 dpi 래스터 이미지
crc_mrgsolve_model.R mrgsolve ODE 모델 (20구획, 7시나리오)
crc_shiny_app.R Shiny 대화형 대시보드 (6탭)
crc_references.md 참고문헌 40개 (섹션별 분류)